Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PrkcaP20444 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms