Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NelfeP19426 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfeP19426 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NelfeP19426 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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