Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tnnc1P19123 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tnnc1P19123 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms