Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RargP18911 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RargP18911 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RargP18911 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RargP18911 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RargP18911 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RargP18911 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RargP18911 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms