Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rps6ka3P18654 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rps6ka3P18654 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms