Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
P18529 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18529 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18529 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18529 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18529 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18529 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18529 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
P18529 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18529 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18529 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
P18529 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
P18529 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
P18529 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18529 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18529 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18529 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18529 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18529 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18529 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18529 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18529 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18529 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18529 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18529 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
P18529 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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