Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P18525 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P18525 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18525 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
P18525 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18525 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18525 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18525 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18525 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
P18525 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18525 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18525 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18525 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18525 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18525 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
P18525 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
P18525 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18525 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P18525 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms