Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PcnaP17918 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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