Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Spi1P17433 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Spi1P17433 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms