Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pou4f1P17208 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pou4f1P17208 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms