Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Hmga1P17095 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Hmga1P17095 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms