Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Irf1P15314 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Irf1P15314 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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