Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Scd1P13516 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Scd1P13516 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Scd1P13516 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms