Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Fv4P11370 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fv4P11370 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms