Protein–RNA interactions for Protein: P0DN91

Tmem254c, Transmembrane protein 254c, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254cP0DN91 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tmem254cP0DN91 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tmem254cP0DN91 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Tmem254cP0DN91 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Tmem254cP0DN91 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms