Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxa9P09631 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxa9P09631 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms