Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxa5P09021 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms