Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefmP08553 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NefmP08553 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NefmP08553 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NefmP08553 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NefmP08553 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NefmP08553 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NefmP08553 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NefmP08553 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NefmP08553 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms