Protein–RNA interactions for Protein: P08042

Zfp1, Zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp1P08042 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zfp1P08042 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms