Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01672 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01672 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01672 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01672 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01672 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01672 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01672 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01672 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01672 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01672 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01672 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01672 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01672 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms