Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Capns1O88456 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Capns1O88456 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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