Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

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Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CaskO70589 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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CaskO70589 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CaskO70589 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CaskO70589 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CaskO70589 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CaskO70589 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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