Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp2a2O55143 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp2a2O55143 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms