Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ptpn20O55082 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ptpn20O55082 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms