Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cacna1bO55017 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cacna1bO55017 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms