Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cited2O35740 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cited2O35740 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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