Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Klf9O35739 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Klf9O35739 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Klf9O35739 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Klf9O35739 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Klf9O35739 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Klf9O35739 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Klf9O35739 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf9O35739 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Klf9O35739 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Klf9O35739 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Klf9O35739 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Klf9O35739 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Klf9O35739 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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