Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Opn1mwO35599 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Opn1mwO35599 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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