Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Stx1aO35526 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx1aO35526 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms