Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slc27a2O35488 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms