Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Nedd9O35177 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nedd9O35177 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nedd9O35177 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nedd9O35177 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nedd9O35177 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Nedd9O35177 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nedd9O35177 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Nedd9O35177 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Nedd9O35177 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nedd9O35177 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Nedd9O35177 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms