Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kif1cO35071 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kif1cO35071 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms