Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcshO08795 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcshO08795 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcshO08795 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PrkcshO08795 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrkcshO08795 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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