Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mfsd4b4J3QNS5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms