Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms