Protein–RNA interactions for Protein: I6XKQ3

Spdye4c, Speedy/RINGO cell cycle regulator family, member E4C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4cI6XKQ3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Spdye4cI6XKQ3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms