Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Arfgef1G3X9K3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Arfgef1G3X9K3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms