Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srp72F8VQC1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms