Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Vmn1r76F8VQ63 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn1r76F8VQ63 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms