Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Gm20538F6Z9R1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms