Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm8005F6YKY3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms