Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Igkv1-99F6XWB2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Igkv1-99F6XWB2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms