Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SmgcF6VRN1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SmgcF6VRN1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms