Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Atf6F6VAN0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atf6F6VAN0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms