Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms