Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Raph1F2Z3U3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Raph1F2Z3U3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms