Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Defa35E9QLQ1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Defa35E9QLQ1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Defa35E9QLQ1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Defa35E9QLQ1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Defa35E9QLQ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Defa35E9QLQ1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Defa35E9QLQ1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Defa35E9QLQ1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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