Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod3E9QA62 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod3E9QA62 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod3E9QA62 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod3E9QA62 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod3E9QA62 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod3E9QA62 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod3E9QA62 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lmod3E9QA62 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lmod3E9QA62 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms