Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

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Length 752 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Susd1E9Q3H4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Susd1E9Q3H4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Susd1E9Q3H4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Susd1E9Q3H4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms