Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ddx60E9PZQ1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ddx60E9PZQ1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms